尽管模仿创新在广东家族企业跨越式发展过程中产生了十分重大的作用，但是宏观环境的变化及竞争激烈程度的加剧，要求企业升级转型，不断向自主创新迈进，进一步提升自身的竞争力。

2008年发生的全球金融危机是这一阶段转型的标志性事件，这次危机使得广东大量加工贸易企业的对外出口急剧下降，这些处于全球产业链中低端的企业瞬间面临空前的危机。金融危机的倒逼机制，外部需求下降，内部劳动力、原材料环境成本持续上升，迫使大量的家族企业开始升级转型。“做代工利润越来越少，现在土地、人力成本又不断上升，要想活下去就必须转型。”谈起广东省的转型升级，东莞一家加工外贸企业负责人如是说。

然而，内外部多种因素导致了不少广东家族企业在自主创新方面的意愿和能力不足，难以步入自主创新之路。而要使企业的研发向自主创新升级，则有赖于企业家精神的再次焕发和创新制度环境的改善。在组织和制度因素的共同作用下，自2008年始，广东家族企业开始步入了从模仿创新逐步向自主创新转型的阶段。