高新技术产业发展水平是衡量一个国家和地区经济实力和竞争力的重要标志，高新技术产业发展战略已成为全世界几乎所有国家和地区的科技战略重点。近年来，广州市的高新技术产业技术创新能力得到政府及社会各界的高度重视，广州市政府为了全面贯彻落实“科教兴市”战略，先后出台了一系列促进高新技术产业自主创新的相关政策。在加大创新投入的同时，更应注重产业技术创新绩效水平的提高。本文结合广州市高新技术产业实际发展历程，纵向分析了广州市2000~2008年9年间的高新技术产业创新投入产出绩效，然后横向与其他6个城市的高新技术产业创新投入产出情况进行了比较分析，找出广州市高新技术产业创新绩效所存在的问题，并据此提出了加强高新技术产业创新绩效的建议及提升创新绩效的途径。最后对广州市政府关于高新技术产业的财政政策支持现状进行了分析，给出相应的建议。