拉美经委会每两年举行一次全体成员国部长级代表大会，讨论有关地区经济和社会发展的重要问题，回顾经委会在过去两年中的工作成绩，确定此后两年的工作计划。每次大会由某一成员国政府负责主持。

拉美经委会的常设性管理机构是秘书处，其主要职责包括：向拉美经委会及其辅助机构提供日常服务和文件资料；就与拉美经委会事务相关的主题展开研究；推动地区和次地区合作与一体化，以促进全地区经济和社会发展；搜集、整理、研究和发布与地区经济和社会发展有关的数据；根据地区各国政府的要求提供咨询服务，筹划、组织和实施各类合作项目；为满足经济和社会发展的需求而制订和推动地区或次地区级别的合作计划，同时发挥计划执行机构的作用；组织各类政府间会议、专家会议以及各类研讨会；帮助地区各国就全球问题形成地区性意见，同时使全球关注拉美和加勒比地区与次地区层面的问题；协调拉美经委会与联合国其他部门及机构的合作。

拉美经委会秘书处位于智利首都圣地亚哥。共设有10个主要业务部门：经济发展处，社会发展处，生产、生产率和经营管理处，可持续发展和人力安置处，自然资源和基础设施处，人口处（即拉美和加勒比人口问题研究中心），国际贸易和一体化处，性别事务处，统计和经济规划处，文献和出版处。秘书处最高领导人为执行秘书。执行秘书接受联合国秘书长的直接领导，向其汇报工作，接受其委派的任务。

拉美经委会的下属机构包括：美洲统计大会、人口与发展特别委员会、南南合作委员会、加勒比发展与合作委员会、拉美和加勒比经济与社会规划学会、拉美和加勒比地区妇女大会。

拉美经委会的经费有两大来源：一是联合国从其日常开支中拨付的资金；二是成员国、各类基金会、联合国其他机构提供的资金，此类资助通常用于完成特定任务。