成立至今，拉美经济体系先后产生9位常务秘书，任期均为4年。其中前7位常务秘书分别是厄瓜多尔人海梅·蒙卡约（Jaime Moncayo，1975～1979）、秘鲁人卡洛斯·阿尔萨莫拉（Carlos Alzamora，1979～1983）、委内瑞拉人塞巴斯蒂安·阿莱格雷特（Sebastián Alegrett，1983～1987）、乌拉圭人卡洛斯·佩雷斯·德尔卡斯蒂略（Carlos Pérez del Castillo，1987～1991）、墨西哥人萨尔瓦多·阿里奥拉（Salvador Arriola，1991～1995）、阿根廷人卡洛斯·莫内塔（Carlos Moneta，1995～1999）、智利人奥托·博耶（Otto Boye，1999～2003）。

第8任常务秘书为委内瑞拉经济学家罗伯托·瓜尔涅里（Roberto Guarnieri），任期为2003～2008年。他曾在委内瑞拉中央银行担任高级顾问等重要职务，并曾在世界银行、国际货币基金组织、安第斯开发公司等国际金融机构任职，经常参与委内瑞拉政府与国际多边机构举行的谈判。

现任常务秘书为墨西哥经济学家何塞·里维拉·巴努埃特（José Rivera Banuet），2008年3月当选，任期为2008～2012年。他毕业于墨西哥自治理工学院，获得经济学学士学位。1988～1993年曾任拉美经济体系特别顾问。曾在联合国开发计划署、联合国贸易和发展会议、美洲国家组织等机构担任经济顾问，并长期参与墨西哥经济领域的领导工作。2005～2008年任拉美一体化协会副秘书长。