美洲区域工人组织的最高权力机关是每4年召开一次的代表大会，负责选举主席、副主席、总书记、司库以及书记处成员。

执行委员会是最高领导机构，负责两次代表大会期间的组织和领导工作，由书记处成员和17名副主席组成。执委会会议每年召开一次。执行委员会下设一个妇女工作者委员会，负责处理妇女劳动者在工作、家庭、社会中的各种政治、社会、经济、劳动、法律、文化问题。

书记处是常设机构，负责处理日常工作，实施代表大会和执委会通过的各种决议、政策和计划。书记处由主席、总书记和分管行政与金融、社会与经济政策、工会政策与教育的3名书记组成。书记处成员会议每3个月召开一次。

美洲区域工人组织的资金来源包括：会员缴纳的会费、自由工联的拨款、经执委会批准的合法捐助。