欧盟加入公约后两院之间的关系，欧洲人权法院对欧共体法已进行的监督，由于欧共体和欧盟不是公约的缔约方，欧洲人权法院并不受理直接针对欧共体的案件，但是欧洲人权法院在对欧共体行为监督方面的观望主义时代已经过去，近来该院已经直接对欧共体法进行审查而且监督的广度日益增加。