2020～2021年，台湾地区旅游业发展面临最大的困境是新冠肺炎疫情的影响。台湾观光管理部门先后推出“台湾永续观光发展方案”与“台湾观光迈向2025方案”，并配以实施措施，力图提振台湾观光业。受新冠肺炎疫情冲击，2020年台湾进岛旅客总人次大幅下跌。入台旅客中以旅游为目的者不断减少。大陆居民赴台游2020年前3个月为7万多人次，从2020年3月至2021年9月全部为零。在进出岛旅游基本停滞的状况下，台湾相关部门采取补助等措施，力图拉升居民岛内旅游，但2020年还是出现岛内旅游总人次和总费用均减少的局面。台湾观光产业基础受到前所未有的冲击，企业倒闭、人才流失严重。为了抗疫情保生存，台当局推出防控疫情、纾困补贴等措施，但对现阶段观光产业的促进效应十分有限。未来，台湾观光业将面临如何恢复被严重打乱的旅游服务体系的艰巨任务。