2001年2月16日，美英联军实施了自1998年12月“沙漠之狐”行动以来，规模最大的空袭行动。“沙漠之狐”行动结束以后，美英联军对伊拉克的空袭行动从未停止，两年时间里，先后出动了2.7万架次的战机对伊拉克许多军事和民用目标进行了突袭。2001年，小布什上台伊始，便下令将军事打击范围从“禁飞区”拓展到巴格达。2月16日，美英军队共出动了50多架飞机，对巴格达郊区的军事指挥中心、通信中心、雷达站、导弹基地等20多处军事设施和一些民用目标进行了半小时的轰炸。自此以后，美国一直对伊拉克保持强大的军事压力，频繁地从美军驻土耳其、沙特等国基地和海湾地区的航母上出动战机，轰炸伊拉克境内的地空导弹阵地、高炮阵地、雷达阵地、通信设施和民用目标。

2002年科特迪瓦爆发内战。2月9～10日，美国为营救本国学生和教职员工，派遣200名军人组成突击队，运用多用途战斗吉普车、车型装甲车、装甲运兵车、直升机等战斗装备实施了撤侨行动。

2002年利比里亚内战不断升级，2003年7月美国实施了名为“闪亮快车”的撤侨行动。美国欧洲司令部联合特遣部队和一支来自“西非国家经济共同体”的部队负责保卫港口安全和开放的任务。至2003年9月8日，共有130名美军驻扎在利比里亚，有3艘军舰在蒙罗维亚附近的海域活动，舰上共载有2200名海军陆战队员和2500名水手。

2004年2月5日，海地爆发全国暴乱。2月29日，联合国安理会举行紧急会议，一致通过了第1529号决议，决定在海地部署一支由美国领导的多国临时部队，帮助恢复海地的和平与稳定。3月2日，美国海军陆战队士兵开始在海地首都太子港街头巡逻。

2004年12月26日，印度尼西亚苏门答腊岛附近海域发生强烈地震并引发特大海啸。美国军队1.3万名官兵（含陆战队2200人）和“林肯”号航母、“好人理查德”号两栖攻击舰等11艘舰只以及50架直升机于2005年1月1日开始参加印尼苏门答腊救灾活动。此次救灾活动是20世纪70年代越战结束以来，美军在亚洲规模最大的一次行动，除了人道主义的目的外，还隐藏着复杂的政治、军事考虑。

在政治上，希望通过对最大的伊斯兰教国家印尼提供人道主义救援来改变穆斯林对美国的印象。正如时任国务卿的鲍威尔在考察印尼灾区时所宣称的，美军此次兴师动众地参与印尼救援行动，是为了给穆斯林世界和世界其他地区的人们一个机会，让他们亲身体会美国的慷慨大方和美国人的价值观，使他们认识到美国不是一个与伊斯兰教、穆斯林为敌的国家，而是一个尊重所有宗教的多样性社会。在军事上，美军企图利用参加印尼救灾的机会，对亚洲尤其是亚太地区进行军事渗透，用鲍威尔的话说，是“国家安全战略的一个投资”。

2005年10月，巴基斯坦北部地区发生地震，美国在18个小时内作出反应。美军飞机向整个受灾地区运送和发放了人道主义物资。巴基斯坦—美国“联合民事—军事灾难救助中心”很好地整合了来自世界各国和国际救助机构的救灾物资。通过战略空运将救灾人员和物资从世界各地运送到巴基斯坦，提高了伙伴国的救助能力。美国建立了可部署的野战医院，以弥补受到破坏的巴基斯坦医疗设施不足。美军工程人员帮助巴基斯坦重新开通了数百英里的道路，使救灾物资能够到达偏远地区。

2006年2月3日，包括13名“基地”组织成员在内的23名罪犯从也门首都监狱中逃脱，越狱者中包括2000年对美国海军“科尔”号驱逐舰实施袭击行动的组织者阿赫迈德·巴达维。10日，美国海军的一支舰队抵达也门附近海域，实施搜捕行动。

2007年1月1日，美国驻非洲国家吉布提海军协助索马里和肯尼亚政府在索马里沿海地区搜捕索教派武装组织伊斯兰法院领导人。7日，驻吉布提的美军特种部队出动A-130战机对逃到索马里南部的“基地”组织成员发动了空袭，数十人被击毙。

2008年，美军多次袭击索马里境内武装组织目标，其中，3月3日美国向索马里南部靠近肯尼亚边境的多布利镇发射多枚导弹，造成至少6人死亡、20人受伤。

2010年1月12日，加勒比海岛国海地首都太子港附近发生里氏7.3级地震，美国海军立即派遣舰只开赴灾区，以最快速度完成了美国游客和侨民的撤离，为美国在当地的官方派出机构、慈善组织和有关人员提供了强大救援。