粮食主产区利益补偿是一项非常复杂的系统工程，要确保粮食主产区利益补偿机制高效运行，必须实现从就农业补农业、就粮食补粮食的做法向统筹粮食主产区和粮食主销区发展、为粮食主产区创造公平竞争环境的思路转变，按照推进城乡发展一体化的要求，把粮食主产区农业和农村发展放到整个国民经济发展和现代化建设的大格局中，把农民增收放到国民收入分配和再分配的大格局中，通过制度创新和政策调整，完善利益补偿配套政策体系，加快形成统筹城乡发展的体制机制，并通过强化利益补偿配套政策的动态评价和调整，充分体现政策的关联性，提高政策的“激励兼容”。