忏悔思想是佛教教义中非常重要的一项，忏悔是对戒律清净的维护和保障。只有做好了忏悔的工作，保证了戒体的清净，才能够进行下一步的禅定、慧观等其他修行法门。蕅益智旭大师对于忏悔思想十分重视，既从传统上继承了《梵网经》的大乘菩萨戒忏悔思想，又对其从义理上进行了更加细微地发挥和弘扬，并且分别针对破了五戒的人按照犯戒程度的不同应当如何进行忏悔进行了详细的考察和论述，极大地丰富了忏悔思想的内容。