流域的生态环境问题关键在水，水问题是流域内各地区生态系统退化的关键诱因。流域水生态系统的修复和保护不仅需要依靠生态系统本身的自我调节和自组织能力，还需要人类的合理参与。本文研究论述了水源涵养功能降低、水沙关系失调、水污染严重等各流域普遍存在的水生态问题及其修复和治理实践，据此分析总结了流域水生态修复和治理中面临的瓶颈制约，即流域水生态治理与经济发展关系难协同、流域水生态治理难避“公地悲剧”、现有法律法规难保跨区域有效协作。最后，本文针对治理过程中面临的痛点问题给出了几点对策建议，以期对推动流域水生态保护高质量进行提供帮助。