基层学术组织治理体系和治理能力的现代化是大学治理改革的关键环节。在学科交叉与融合的政策背景下，学部制改革以学科群和学科门类为依据重新整合高校院系组织，搭建跨学科合作平台，为学科之间的交叉与融合提供了组织保障。北京工业大学致力于学部的实体化、制度化改革，提升了传统院系的学科层次，统筹和整合资源，集成学科群体优势，促进学科交叉与融合，同时管理重心下移，提升了高校内部治理的效率与效益。不过，学部治理涉及纵横交错的权力网络，如何平衡横向、纵向的权力冲突，激发学部下设院系由简单拼凑走向高度契合仍需持续关注。