由西方典型国家的经验，可以发现，建构政府部门间协调机制需要兼顾政府职能定位与政治生态平衡“两层次逻辑导向”的作用，并在此基础上重视机制调整的重要性。在当前中国，也需要改变传统仅仅依靠政府职能定位的“单向度改革”思路，推进“两层次逻辑导向”并重的“均衡型改革”，突破“碎片化”机制，建构中国式的“跨部门协作”机制。然而，作为世界上最为复杂、最富于变化的国度，中国的“跨部门协作”所面临的复杂性将远远地大于西方典型国家，单纯地依赖于宏观的体制建构，或仅针对具体问题进行细枝末节的应对，都难以有效地推进政府部门间协调机制的建构。因此，建构“跨部门协作”机制需要从宏观思路、中观战略与微观措施三个层面有系统地、全面地考量。