大学功利现象与高校办学自主权密不可分。办学自主权的不足，容易导致高校诸多领域的功利现象。合理界定政府与大学组织的自主权有利于大学的和谐发展。判定大学组织是否具有合理的自主权，应当看大学的“法人代表”是主要作为“委托人”的政府的“代理人”，还是主要作为学术组织自身的“代理人”。只有当“法人代表”主要作为学术组织自身的代理人时，高校才能真正享有办学自主权。