在清季咸同年间山东地区“民间军事化”的环境中，限于各种主客观条件，清山东地方政府对民间良性群保组织太谷学派在黄崖山的聚众行为进行了错判，以致酿成黄崖山惨案。整个错判及善后的结果既反映了山东地方政府处理相关问题的简单粗暴，也暴露出在当时的社会环境下，地方政府决策者失去了理性判断的空间与可能。这个事件并非特例，充分暴露了晚清“民间军事化”的环境中，地方政府与民众之间对立紧张的现实与一触即发的矛盾压力。