上海合作组织自2001年正式成立以来，以新安全观为指导，在军事合作领域取得了一系列显著成就，解决了边界划分及边境安全问题，成员国之间实现了军事互信，制定了打击“三股势力”的一系列法律文件，建立了国防部长会晤等会议机制，举行了七次联合反恐军事演习。与此同时，上海合作组织在继续深化军事安全合作方面还面临许多问题与挑战，应正确认识上述问题，探索灵活科学的发展思路，拿出切实可靠的合作举措。