特殊的自然条件形成的独特的生态系统，是建立以保护珍稀生物种源和独特自然生态系统自然保护区的非常有利的天然条件。西藏人口稀少，分布相对集中，尚有几十万平方公里的高原天然动物园和人迹罕至的原始林区，藏族人民保护“圣地”的习惯，更是西藏高原自然保护区最为优越的特色。到 2000年底统计，全区共建立各类自治区级以上的自然保护区18处，总面积40124060公顷（约40.12万平方公里）约占西藏全区面积的32.9%，占中国现有自然保护区总面积的一半以上。自然保护区虽然面积都相对较大，但大部分自然保护区内都没有居民。即使是有居民生活的保护区，人口所占的密度也极小，生产、开发力度基本上没有影响到原始的自然景观，是中国自然保护区内少有的特色。现有保护区保护了西藏地区绝大部分濒危和珍贵野生动植物及其栖息地生态类型，也包含了许多自然地理和生物多样性之最。