全球产业链重构，“堵链”“断链”问题频发，使得提升产业链韧性、维护产业链安全成为全球主要经济体面临的重要发展议题。本文从产业组织理论视角对产业链及产业链韧性进行了理论界定，分析了其大变局下的多重不确定性、关系现代产业安全的基础重要性以及自主创新在产业链韧性提升中的关键性等时代特征。以民办科研机构为代表的新型研发机构是我国自主创新体系中的重要力量，本文在对我国民办科研机构发展现状进行梳理的基础上，采用纵向单案例研究方法，以北京协同创新研究院为例，就科技类民办非企业类型的新型研发机构进行了运行机制分析，并总结其主要优势与面临的挑战。结合理论分析、现状分析、案例分析，文章最终从多元主体协同、业务领域融合、组织结构平台化等方面分析了民办科研机构助力产业链韧性建设的发展趋势并提出相关对策建议。