普京执政及之后的梅普组合时期，大学与政府的关系与叶利钦时期不同，表征为政府控制的重新加强。由于20世纪90年代那场突变对整个俄罗斯的社会产生了深刻的影响，俄罗斯政府采取所谓的“休克疗法”彻底失败，国家和民众都对西方模式的“自由主义”感到失望，而转向立足于民族传统和文化并结合世界经验的“第三条发展道路”，俄罗斯社会上下选择了既不实行激进改革也不走回头路的保守主义改革模式。相应的，高等教育也随着国家文教观的变化而转向。大学与政府关系开始新一轮的钟摆，即由大学自治一极向政府控制一极移动，“国家主义”再次回归。政府回归大学管理事务表现在很多方面，如确立了教育优先发展战略、修改法律、设置大学自治的边界、加大政府教育财政支出以及实施国家统一考试等教育政策。