博士生培养过程中的师生关系最能触发导师和博士生双方的共同关切，直接影响到博士生教育教学实践的改变和质量的提升。本文从影响博士生师生关系的几个关键问题出发，分析得出存续于师生之间的心灵性对话的内涵与特征。心灵性对话彰显师生关系的主流理念与博士研究生教育价值的新方向。构建心灵性对话的师生关系聚焦于五个方面：以培植科学视野与学术理性为中心；自觉形成生态性的师德、学养改良模式；朝向共同愿景而达成的心灵契约；超越与翻转传统课堂教育模式；直抵彼此内心深处的宽容与关爱。