研究生组织是研究生教育与管理的重要载体，研究生组织的良性运行是研究生组织建设的重要议题。目前，高校研究生组织在运行中存在组织目标及权责不明确，组织自治偏离，组织官僚化及过度意识形态化，工作缺乏创新性，组织管理缺乏连贯与衔接，不能体现学生发展的目标等问题。学生发展理论从学生个体发展的角度对研究生组织的建设提供了借鉴，为此，可通过明确责任、确立制度、创新方式等举措提升研究生的自我管理能力，通过给予学生适当自治权的方式加强研究生组织的有效管理，保证研究生教育管理工作的良性运行。