上海的新兴产业有生物医药制造业、光电子产业和新材料产业。2004年，上海市生物医药产业产出持续增加，并保持平稳增长的势头。上海市生物生化制品制造业实现工业总产值25.90亿元，同比增长5.84%。2004年，上海市生物生化制品制造业销售收入和利润均出现较大幅度下滑；实现产品销售收入23.27亿元，同比减少19.81%；实现利润2.45亿元，同比减少40.1%。外商和港澳台投资企业占据了上海市生物医药制造业40%左右的份额，盈利能力也大大优于其他经济类型企业。上海市是中国最重要的光电子科学研究和产业化基地，光电子产业年均增速在20%以上，已经形成了较为完整的产业链，光通信和光显示产业在国内优势明显。上海已有光电子企业300余家，年产值200多亿元。但与国内外光电子产业发展水平相比，上海光电子产业在产业科技投入、资金投入、大企业进入和人才培养等方面还有一定差距，行业发展还处于初期。自1995年起，新材料产业同电子信息、生物医药一起被列为上海市优先发展的三大高新技术产业之一，并已形成了包括新型金属材料、新型无机材料、新型有机高分子材料、新型复合材料、新型建筑材料、纳米及粉体材料等完整的新材料体系。目前，上海已成为中国新材料产业的重要科技开发和生产基地之一。