制度创新应当适应社会的发展水平，并且随着社会秩序的逐渐生成，由系统本身来修改规则。遵循自组织协同动力学方法论的基本思想：在相同起跑线上，一定要有竞争意识。这种竞争不是向后拉别人的非合理的或不正当的竞争，竞争的意义就是始终要跑在前面，竞争因此只是一种目标意义的竞争，竞争中实力的作用与策略的作用，两者都非常重要，不能顾此失彼；要保持自己在竞争中的特色，如果没有特色，就没有竞争者合适的位置，就可能逐渐落后，形成可制约、可相互促进的整体功能与结构合理分布的系统；通过合作才能使得整体获得演化意义上的发展，如一个捕食者与被捕食者的关系，不是捕食者把被捕食者吃光，吃光被捕食者，捕食者等于把自己也淘汰出局。即使是在与敌人的竞争中，也需要一种合作，利益的制约、共同的需要都决定了不能把对方淘汰出局；在适当条件下，合作关系的确可以通过自组织的博弈，在一个没有权威的利己主义者的环境中产生。合作关系的发展需要个人、组织之间有充分的、长久的利益关系，有一再交往的机会，以便双方看到在将来的相互交往中，仍然存在着利害关系。制度规定下的竞争与合作，其实却是人与人之间的竞争与合作。制度强调人与社会的关系，而这实质上是人与人的关系。但是，跟未来有关的制度，依然体现为人与社会的关系，它反映的是建立在共同心理需要基础之上的群体无意识。制度的目的有时与获得的结果并不一致，这是没有办法的，在涉及利益关系时，人与人、人与社会之间的关系都存在非合作均衡问题。社会问题往往发生在各种利益边缘，制度创新在社会发展中的意义十分重大。