两岸行政关系，与大陆政权对福建的经营管理和福建人口状况密切相关。东吴、隋朝出兵台湾，都是因为当时福建过于荒凉，人口稀少，而这两个王朝都有急于开发福建的愿望，所以都从台湾掳归人口补充。到了唐朝，北方人口过剩，汉人大量南下，加上本土自然繁衍，福建人口迅速增长，本土开发成为当时的地方治理重点，因此，尽管唐朝有很强盛张扬的国力，却反而不太涉足海岛。经过闽国时期和宋朝，福建得到长足发展，迅速成为全国经济文化领先地区，开始出现人口过剩，许多人口涌向海岛寻求谋生空间，澎湖、台湾越来越成为福建沿海居民频繁往来的地方甚至移居地。跟随居民移徙所至，地方行政管理也有必要扩大范围。从宋到明，闽台行政关系已初步产生。