荷兰殖民者用武力和讹诈手段占据台湾，却未敢公然宣称对台湾拥有主权，明王朝也从未承认荷兰人占据台湾的合法性和合理性，福建地方官员和民间有识之士长期都有收复台湾并设置郡县的思想准备。17世纪中叶，风雨飘摇的明王朝，在农民战争和满族政权的连续打击下轰然倒塌。清朝的铁骑长驱南下，明朝的残余势力退却于东南，福建继宋末抗元之后，再次担当起了支撑流亡朝廷作最后抵抗基地的角色。与宋幼帝在福州毫无立足根基的命运有所不同的是，南明政权得到了长期经营台湾海峡、掌握强大军事实力的郑氏集团的拥戴；而郑氏这个起于草根的地方集团，也借此历史机缘戴上了代言正统王朝的光环，获得丰厚的政治资源。郑氏虽未能最终实现反清复明的大业，却以代表中国正统王朝的姿态，立下收复台湾的历史奇功。这个遗民政权，恰恰在明王朝退出历史舞台的最后时刻，续写了它要设治台湾的未尽篇章。从此，台湾属于中国的主权观念，便无可置疑地树立起来。这也是以闽人为主体的大陆人民长期开发台湾瓜熟蒂落的必然结果。