学术界有人指出：专家咨询论证的独立性是指专家的决策咨询不受政治和行政因素的影响，不受长官意志的束缚，独立自主地进行决策研究，客观科学地进行决策咨询。从总体上说，专家咨询论证的独立性包括两个方面，一是专家在发表咨询论证意见时应恪守职业道德准则，保持其独立性，而不受外部因素的干预和影响；二是政府机构应为专家客观、中立地发表咨询论证意见创造 条件，保证专家独立地进行咨询论证而不对其咨询论证工作施加不当影响进而改变其咨询论证意见。